La banda grabó un demo llamada "Rage Against the Machine". Tenía doce canciones. Siete de esas doce canciones se incluirían en su primer álbum. Muchos sellos discográficos importantes se interesaron por la banda después de que sacaran su maqueta. Rage Against the Machine firmó con Epic Records. Morello dijo que "accedieron a todo lo que la banda pidió".
El primer álbum de la banda, "Rage Against the Machine", se lanzó en 1992. Vendió muchas copias, siendo "Killing in the Name" la canción más popular del álbum. Para que más gente escuchara el álbum, la banda actuó en el Lollapalooza de 1993.
Después del éxito de su primer álbum, Rage Against the Machine grabó algunas canciones para bandas sonoras de películas, como "Tire Me" y "Year of tha Boomerang". Lanzaron su segundo álbum, "Evil Empire", en 1996. Llegó al número uno en la lista musical Billboard 200.
En abril de 1996, Rage Against the Machine actuó en Saturday Night Live. Planeaban tocar dos canciones, pero su segunda canción fue cancelada. Esto se debió a que intentaron colocar banderas estadounidenses boca abajo sobre sus amplificadores (una bandera invertida es un signo de peligro). Las banderas eran una protesta porque el programa tenía al republicano Steve Forbes como invitado esa misma noche.

En 1997, Rage Against the Machine salió de gira con U2. Todo el dinero que Rage ganó con los conciertos se donó a grupos que apoyaban, como el EZLN y Women Alive. Después de girar con U2, Rage comenzó su propia gira por Estados Unidos. Planeaban hacerla con Wu-Tang Clan, pero los reemplazaron con The Roots después de que no se presentaran a un concierto. La banda lanzó un álbum recopilatorio de canciones de su maqueta y grabaciones en vivo llamado "Live & Rare" en 1998.
En 1999, Rage Against the Machine actuó en Woodstock. La banda luego lanzó un álbum llamado "The Battle of Los Angeles". Vendió más de 450.000 copias y llegó al número uno en el Billboard 200. La música de Rage se incluyó en la banda sonora de las películas de la serie "The Matrix".
En enero de 2000, la banda grabó un videoclip para "Sleep Now in the Fire" en Wall Street. Cientos de personas fueron a ver a la banda grabar el video. Michael Moore, quien filmaba el videoclip, solo tenía un permiso para estar frente al Federal Hall. A la banda no se le permitía hacer ruido fuerte, pero siguieron tocando a alto volumen. Tom Morello dijo que Moore les dijo que "pase lo que pase, no dejen de tocar". Cuando la banda se alejó de la entrada del Hall, agentes de policía esposaron a Moore. Moore le dijo a la banda que "tomen la Bolsa de Valores de Nueva York", y mucha gente comenzó a correr hacia el edificio. La Bolsa de Valores cerró y nadie pudo operar durante un tiempo por culpa de la banda.

En septiembre de 2000, la banda asistió a los premios MTV Music Awards. Cuando Limp Bizkit ganó el premio al Mejor Video de Rock en lugar de Rage, Tim Commerford trepó por una estructura de andamio de la ceremonia. De la Rocha se fue de la premiación después de esto, y Commerford pasó una noche en la cárcel.

En octubre de 2000, de la Rocha dejó la banda. Creía que Rage tenía muchos problemas que hacían que los miembros de la banda no trabajaran bien juntos. A finales de año, la banda lanzó "Renegades", un álbum de versiones. Contenía canciones originales de muchas bandas, como Devo, the Rolling Stones, Cypress Hill y Bob Dylan. Fue certificado disco de platino por la RIAA.
Después de que de la Rocha dejara la banda, Morello, Commerford y Wilk quisieron seguir haciendo música. Decidieron buscar a otro cantante y formar una nueva banda. Rick Rubin, un productor musical, les dijo que deberían tocar con Chris Cornell de Soundgarden. Cornell aceptó cantar y formaron la banda Audioslave. En noviembre de 2002, la banda lanzó su primer álbum, que también se llamó "Audioslave". A mucha gente le gustó el álbum. En comparación con Rage Against the Machine, Audioslave no era muy político. La banda hizo dos álbumes más, llamados "Out of Exile" y "Revelations". En febrero de 2007, Audioslave se separó después de que Cornell dejara la banda.
Ese año también trajo la tan esperada reunión de Rage Against the Machine. Primero, la banda tocó en el día de clausura del festival Coachella de 2007, luego en 2008 le siguieron varios otros conciertos, generalmente coincidiendo con festivales importantes en Europa y EE. UU. No surgió nuevo material de estudio de Rage Against the Machine, pero de la Rocha colaboró con el ex baterista de Mars Volta, Jon Theodore, en un grupo llamado One Day as a Lion, lanzando un EP ese año.

El siguiente estallido de actividad de Rage llegó en 2009 cuando hubo una campaña en Internet para llevar "Killing in the Name" a lo más alto de las listas del Reino Unido, con la esperanza de impedir que un ganador de "X Factor" ocupara el primer puesto. La campaña viral funcionó y Rage dio un concierto gratuito de celebración en Finsbury Park en el verano de 2010. A pesar de todos estos conciertos —incluida una aparición en el verano de 2011 en L.A. Rising, un festival que organizó la banda— y los rumores de un nuevo álbum, no aparecieron grabaciones.
En 2013, su álbum debut recibió una reedición de lujo y, dos años después, el concierto de Finsbury Park de 2010 se publicó como un lanzamiento en CD/DVD. Al año siguiente, Morello, Wilk y Commerford se unieron a Chuck D de Public Enemy y B Real de Cypress Hill para formar el supergrupo Prophets of Rage, lanzando un álbum homónimo en 2017.
Cuando 2019 llegaba a su fin, Rage inició una nueva década con más informes de un regreso. Más tarde se confirmaron actuaciones en Coachella, el inicio de una gira mundial que emparejaría a la banda veterana con el dúo de rap afín (y frecuentes colaboradores de de la Rocha) Run the Jewels. Sin embargo, los planes se detuvieron en marzo, cuando la pandemia de COVID-19 obligó a cancelar la mayoría de la música en vivo de 2020.

En junio de ese año, mientras estallaban protestas contra la brutalidad policial en todo el mundo tras la muerte de George Floyd, los álbumes de Rage volvieron a las listas de Billboard y de streaming. Finalmente, pudiendo salir a la carretera, la banda regresó a los escenarios en 2022 para un puñado de shows, pero una lesión les obligó a cancelar las fechas restantes de la gira. Después de ser incluidos en el Salón de la Fama del Rock & Roll en 2023, la banda confirmó que se habían separado nuevamente a principios de 2024.