La banda holandesa Epica, que en un principio se hacía llamar Sahara Dust, se formó a principios de 2003 cuando Mark Jansen, guitarrista de After Forever, decidió separarse del grupo que había ayudado a fundar para iniciar su propio proyecto de metal operístico.

Tras incorporar a la mezzosoprano adolescente Simone Simons, al guitarrista Ad Sluijter, al teclista Coen Janssen, al bajista Yves Huts y al baterista Jeroen Simons, Epica entró al Gate Studio de Wolfsburg, Alemania, con un coro y una sección de cuerdas de formación clásica para grabar su ambicioso álbum debut, The Phantom Agony. Lanzado por Transmission Records a finales de 2003, el álbum generó varios sencillos.

El éxito inicial de la banda allanó el camino para su segundo LP de 2005, Consign To Oblivion, que también tuvo un buen desempeño en las listas de los Países Bajos. Tras su cambio al gigante del metal Nuclear Blast y la incorporación de Ariën van Weesenbeek en la batería, Epica lanzó su primer álbum conceptual, The Divine Conspiracy, en 2007. Este álbum entró en las listas de toda Europa, al igual que Design Your Universe de 2009, que igualó su mejor posición en las listas holandesas al alcanzar el puesto número ocho; Design Your Universe también contó con un nuevo miembro, ya que Isaac Delahaye asumió las tareas de guitarrista.

El quinto álbum de estudio de Epica, Requiem For The Indifferent, salió a la venta en 2012. Fue el primero en entrar en las listas del Reino Unido y Estados Unidos, tras lo cual otro cambio en la formación llevó a que Huts dejara su lugar a Rob van der Loo en el bajo. La banda celebró su décimo aniversario en marzo de 2013 con un concierto especial en Eindhoven, titulado y posteriormente lanzado como Retrospect, en el que incluso participaron los exmiembros Sluijter, Simons y Huts. Apenas un año después, la banda fijó el lanzamiento de su sexto álbum de estudio, The Quantum Enigma, para mayo de 2014.

Epica reveló en su sitio web oficial los primeros detalles sobre su sexto álbum el 5 de febrero de 2014. Se anunció que el nuevo álbum se titularía The Quantum Enigma y se lanzaría a principios de mayo de 2014. Más tarde ese mismo mes, la banda dio a conocer la portada del álbum, creada por su colaborador de larga data Stefan Heilemann para reflejar las ideas detrás de las letras. Ese mismo día también se anunciaron la lista de canciones y las fechas de lanzamiento, y finalmente, Nuclear Blast lanzó The Quantum Enigma el 2 de mayo (Europa), el 5 de mayo (Reino Unido) y el 13 de mayo (EE. UU.). El álbum fue producido por Joost van den Broek y grabado en los estudios Sandlane Recording Facilities en los Países Bajos. The Quantum Enigma debutó en el puesto 110 de la lista Billboard 200 de EE. UU., lo que lo convirtió en la segunda entrada de Epica en esta lista; la primera fue Requiem for the Indifferent, que entró en febrero de 2013. En el país de origen de Epica, los Países Bajos, el álbum alcanzó el puesto n.º 4, lo que lo convirtió en su álbum con mejor posición en la lista.

El 17 de marzo de 2014, el primer sencillo, «The Essence of Silence», se puso a la venta como descarga digital. Tres días después, se lanzó un video con la letra. «Unchain Utopia» fue elegido como segundo sencillo y se lanzó el 8 de abril de 2014. En una entrevista con la revista en línea Sonic Cathedral, la vocalista principal, Simone Simons, confirmó que pronto se lanzaría un video musical para «Unchain Utopia». Sin embargo, en su lugar se lanzó un video con la letra, que incluía imágenes filmadas originalmente para el video musical. Más tarde, la banda decidió grabar un video musical para la canción «Victims of Contingency», que se estrenó el 30 de octubre de 2014.

La banda regresó a los escenarios después de casi un año, el 30 de abril de 2013, en Tilburg, en su país natal, los Países Bajos, en un concierto para celebrar el lanzamiento del álbum. A lo largo de 2014 y 2015, la banda realizó giras por Europa, Asia, África y tanto América del Sur como América del Norte para promocionar The Quantum Enigma. Su última presentación antes de regresar al estudio tuvo lugar el 22 de noviembre de 2015 en el «Klokgebouw» de Eindhoven, Países Bajos, donde Epica había celebrado su gira Retrospect. El concierto formó parte de la primera edición del «Epic Metal Fest», un festival organizado y curado por los miembros de la banda. Epica anunció el Epic Metal Fest el 3 de junio de 2015 en su sitio web oficial y reveló que en el festival se les unirían las bandas DragonForce, Eluveitie, Fear Factory, Moonspell, Delain y Periphery.

El 5 de junio de 2015, Epica recibió el Music Export Award en Buma Rocks, que se otorga al grupo holandés con mayor éxito internacional durante el año anterior.

El 31 de mayo de 2016, Epica confirmó el título de su nuevo álbum: The Holographic Principle, que salió a la venta el 30 de septiembre de 2016. La banda había anunciado previamente que el álbum se lanzaría como parte de su presentación en la segunda edición del Epic Metal Fest, pero más tarde modificó esta información, indicando que se lanzaría un día antes.

El 1 de septiembre de 2017, la banda lanzó su primer EP, The Solace System, durante la segunda etapa norteamericana de la gira. El EP incluye seis canciones que se planificaron y grabaron, pero que nunca se incluyeron en The Holographic Principle.

Epica lanzó un EP el 20 de diciembre de 2017 en Japón titulado Epica vs Attack on Titan Songs, que incluye versiones de canciones del anime Attack on Titan. El EP se lanzó a nivel mundial el 20 de julio de 2018.

El 3 de julio de 2019, Epica anunció que lanzaría su primer libro más adelante ese mismo año. Este incluiría la historia de la banda, entrevistas y fotos.

La banda anunció el 17 de julio de 2019 que el 4 de octubre de 2019 se lanzaría una Edición Oro de su álbum Design Your Universe, con motivo de su décimo aniversario, junto con una gira.

Simone Simons declaró el 1 de febrero de 2020 que la preproducción del próximo álbum había concluido. El 11 de marzo de 2020, la banda entró al estudio para comenzar a grabar su nuevo álbum y, a su vez, publicó vlogs de estudio que mostraban el proceso de creación de su próximo octavo álbum de estudio. Mark Jansen dijo en una entrevista que la fecha de lanzamiento del álbum podría retrasarse debido a la pandemia de COVID-19. El 17 de abril de 2020 se informó que Simone Simons había terminado de grabar las voces para el nuevo álbum. Mark Jansen confirmó posteriormente, el 2 de septiembre de 2020, que el álbum había sido grabado, mezclado y masterizado, y que las orquestaciones y los coros se habían completado antes de que la banda comenzara a grabar.

Posteriormente, el 7 de octubre de 2020, Nuclear Blast anunció el título del octavo álbum de estudio de la banda, Omega, junto con la fecha de lanzamiento: el 26 de febrero de 2021. El 9 de octubre de 2020 se lanzó el primer sencillo del álbum, «Abyss of Time – Countdown to Singularity», acompañado de un video musical oficial. El segundo sencillo del álbum, «Freedom – The Wolves Within», se lanzó el 27 de noviembre de 2020, junto con un video musical. El tercer sencillo, «Rivers», se lanzó el 22 de enero de 2021, junto con un video visualizador. Para promocionar el álbum, la banda realizó un evento transmitido en vivo titulado «Omega Alive», que tuvo lugar el 12 de junio de 2021. Se lanzó en varios formatos de audio y video el 3 de diciembre de 2021.

El 16 de septiembre de 2022, la banda anunció su tercer EP, The Alchemy Project, un proyecto colaborativo en el que cada canción cuenta con al menos un artista invitado. Se lanzó el 11 de noviembre de 2022 a través de Atomic Fire. Fue acompañado por videos musicales oficiales para las canciones «The Final Lullaby» y «Sirens – Of Blood and Water». En mayo de 2023, Epica fue elegida para abrir los conciertos de Metallica junto con Ice Nine Kills en una breve serie de presentaciones en París y Hamburgo como parte de su gira mundial M72, en sustitución de Five Finger Death Punch, quienes habían cancelado sus presentaciones por motivos de salud. El 7 de noviembre de 2023, la banda anunció The Symphonic Synergy, una serie de cuatro conciertos especiales con orquesta y coro, que se llevarían a cabo en Ámsterdam los días 19 y 20 de septiembre de 2024, y en la Ciudad de México los días 6 y 7 de diciembre de 2024.

Simons declaró en una entrevista en marzo de 2024 que el noveno álbum de estudio se encontraba en producción y estimó que el álbum se lanzaría en 2025. El álbum Aspiral se anunció el 30 de enero de 2025, coincidiendo con el lanzamiento del nuevo sencillo «Cross the Divide» y tras el lanzamiento del sencillo «Arcana». El álbum retomó la serie «A New Age Dawns», que se inició en Consign to Oblivion y continuó en Design Your Universe.