Gin Blossoms pasó del circuito del rock universitario a las listas de éxitos pop en 1993, cuando los sencillos «Hey Jealousy» y «Found Out About You» entraron al Top 40 de Billboard. En comparación con las oleadas de grunge que surgieron tras el éxito de Nirvana, Gin Blossoms evocaba una época anterior —específicamente, el sonido vibrante de los años 80, cuando el sur de Estados Unidos bullía de bandas que se esforzaban por imitar el sonido resonante de R.E.M. Sin duda, New Miserable Experience, el álbum de debut del grupo con un sello discográfico importante en 1992, sonaba como un alma gemela del rock universitario de los 80, aunque estuviera potenciado con guitarras potentes que lo hacían encajar perfectamente en la explosión del rock alternativo de los 90. A pesar de acumular varios éxitos a mediados de los 90 —una racha que alcanzó su punto máximo en 1996, cuando «Follow You Down» llegó al Top 10 de Billboard y su cara B, «Til I Hear It from You», se quedó en el puesto 11 —, Gin Blossoms se vio acosado por problemas internos, entre los que destacaba lidiar con las secuelas de la salida y el posterior suicidio del guitarrista Doug Hopkins, quien compuso la mitad de New Miserable Experience. Estas tensiones llevaron al grupo a separarse en 1997, pero tras un receso de cinco años, se reunieron para grabar un álbum y realizar una gira. A partir de ese momento, Gin Blossoms se mantuvo activo, lanzando álbumes cada pocos años y realizando giras con regularidad, atrayendo a un público que recuerda con cariño sus éxitos de los 90.

Doug Hopkins formó Gin Blossoms en 1987 en Tempe, Arizona, junto con el bajista Bill Leen, el vocalista y guitarrista Jesse Valenzuela, el guitarrista Richard Taylor y el baterista Chris McCann. Su primer año fue tumultuoso, ya que el grupo sufrió varios cambios en su formación: McCann fue reemplazado por Dan Henzerling —poco después, este sería reemplazado por Phillip Rhodes—, mientras que Taylor fue despedido y reemplazado por el guitarrista rítmico Robin Wilson, quien también se convertiría en el vocalista principal. Posteriormente, Wilson y Valenzuela intercambiaron los roles de vocalista principal y guitarrista rítmico, y la banda se convirtió en un referente en el circuito de Arizona. En 1989 financiaron por su cuenta su álbum debut independiente, Dusted, que atrajo suficiente atención como para que A&M firmara con el grupo al año siguiente.

La transición a un sello discográfico importante no fue fácil. En 1991, Gin Blossoms intentó grabar un álbum completo, pero solo logró lanzar el EP Up and Crumbling. Tras su lanzamiento, el grupo se dirigió a los estudios Ardent en Memphis para grabar un álbum con el productor John Hampton, pero esas sesiones también fueron problemáticas, debido al empeoramiento de la depresión y el alcoholismo de Hopkins. A&M terminó interviniendo, exigiendo que la banda despidiera a Hopkins o fuera expulsada del sello. Gin Blossoms despidió a Hopkins —quien fue reemplazado por Scott Johnson, cuyo puesto temporal se convirtió en permanente en 1994— y terminó el álbum que se convirtió en New Miserable Experience.

Lanzado en agosto de 1992, New Miserable Experience tardó un tiempo en ganar impulso. Gin Blossoms y A&M promocionaron el álbum de manera constante, lo que llevó a que New Miserable Experience ingresara al Billboard 200 en mayo de 1993, y que «Hey Jealousy», compuesta por Hopkins, lo siguiera al Hot 100 en julio. «Hey Jealousy» acabaría alcanzando el puesto 25 en la lista Hot 100 y el número cuatro en la lista Album Rock de Billboard, lo que impulsó al álbum del que formaba parte hacia posiciones más altas en las listas. Mientras Gin Blossoms experimentaba su primer éxito, Hopkins entró en una espiral descendente que culminó con su suicidio el 5 de diciembre de 1993.

Gin Blossoms siguió avanzando mientras «Found Out About You», un sencillo lanzado en octubre de 1993, subía en las listas. Igualaría el puesto número 25 alcanzado por su predecesor en el Top 40, al tiempo que se convertiría en el primer sencillo del grupo en aparecer en las listas de Modern Rock, donde alcanzaría el número uno. New Miserable Experience se mantendría en las listas durante todo 1994 gracias a su constante difusión y a los nuevos sencillos «Until I Fall Away» y «Alison Road», que alcanzaron el puesto 21 y 24, respectivamente, en el Hot 100. El álbum fue certificado doble platino en agosto de 1994; en mayo de 1996, fue certificado cuádruple platino.

Mientras el grupo trabajaba en su tercer álbum, se mantuvieron en las listas de éxitos gracias a «Till I Hear It from You», su contribución a la banda sonora de Empire Records. Coescrita por Valenzuela, Wilson y Marshall Crenshaw, «Till I Hear It from You» fue un gran éxito en la radio —alcanzó el puesto número cuatro en la lista Album Rock y el cinco en Modern Rock—, pero no se lanzó como sencillo oficial hasta que apareció como doble lado A junto a «Follow You Down», el primer sencillo del segundo álbum del grupo, Congratulations I’m Sorry. Coproducido una vez más por John Hampton, Congratulations I'm Sorry debutó en el puesto 10 tras su lanzamiento en febrero de 1996, en parte gracias al éxito de «Follow You Down», que se convirtió en el primer éxito del grupo en el Top 10 de la lista Hot 100. Congratulations obtuvo la certificación de oro en abril de 1996 —a la que siguió una certificación de platino en junio de 1997—, pero no logró mantenerse en las listas: «Day Job», su segundo sencillo para la radio, se estancó en el puesto 21 de la lista Modern Rock y en el 29 de la lista Mainstream Rock, mientras que «As Long as It Matters» no pasó del puesto 75 en la lista Hot 100.

El bajo rendimiento de Congratulations frenó el impulso de Gin Blossoms, y el grupo pronto se desintegró, disolviéndose a principios de 1997. Wilson y Rhodes formaron luego los Gas Giants, mientras que Johnson tocó con Roger Clyne & the Peacemakers. Wilson fue el líder de los Gas Giants hasta junio de 2001, cuando la banda anunció una «pausa indefinida».

En diciembre de 2001 se anunció la reunión de Gin Blossoms, y el grupo —ahora con Phil Leavitt de Dada en la batería— ofreció un concierto de Nochevieja ese mismo año. La reunión se volvió permanente, y la banda realizó giras regularmente a principios de la década de 2000, período durante el cual se fueron alternando los bateristas: Gary Smith reemplazó a Leavitt antes de que Scott Kusmirek se convirtiera en el baterista en 2002 (Rhodes se reincorporó brevemente a la banda en 2005, pero eso no salió bien).

Major Lodge Victory, el cuarto álbum de Gin Blossoms, salió a la venta con Hybrid Records en 2006, una década después de Congratulations I’m Sorry; entró en la lista Billboard 200 en el puesto 159. En 2008, John Richardson reemplazó a Kusmirek como baterista de la banda; Kusmirek participó en el álbum de 2009 Live in Concert, publicado por Cleopatra. Otro álbum de estudio, No Chocolate Cake, salió a la venta con 429 Records en 2010; debutó en el puesto 73 de las listas de Billboard. Tras su lanzamiento, Richardson dejó la banda y fue reemplazado por Scott Hessel, quien hizo su debut en la gira recopilatoria de rock alternativo de los 90 Summerland en 2012.

Gin Blossoms siguió de gira durante la década de 2010 y en 2016 entró al estudio para grabar un nuevo álbum con Don Dixon y Mitch Easter, el equipo de producción detrás de los primeros discos de R.E.M. El resultado, Mixed Reality, salió a la venta en junio de 2018.

En enero de 2022, Gin Blossoms anunció una gira para celebrar el 30.º aniversario de New Miserable Experience. La gira se interrumpió en marzo de 2022 debido a un accidente en el que el bajista Bill Leen se fracturó el brazo.

Gin Blossoms realizará una gira por Norteamérica en el verano y el otoño de 2026 junto a Blues Traveler y Spin Doctors. Los integrantes de la banda han confirmado que están trabajando en un nuevo álbum que seguirá a Mixed Reality.